畜禽糞便和作物秸稈等農業廢棄物中含有豐富的植物營養元素和有機質，是一種良好的有機肥源，能夠提高土壤的可利用性氮、磷、鉀、有機質的含量以及促進地上植物的生長。但如果對有機肥設備肥料沒有進行正確使用會有怎樣的效用呢?
有機肥設備肥料的錯誤使用的嚴重后果：
1、發生毒氣危害。未腐熟的糞便在分解的進程中發生甲烷、氨等有害氣體，使土壤和作物發生酸害和根系損傷。
2、少量養分流失。在傳統堆漚糞便的進程中，由于自然分解、風吹雨淋等原因，氮磷鉀等養分糜費流失十分嚴重，一般應用率只有50%。
3、招致土壤缺氧。未腐熟的糞便在分解的進程中會消耗土壤中的氧氣，使土壤暫時性地處于缺氧狀態，在這種缺氧狀態下，會使作物生長受抑制。
4、肥效分明遲緩。未發酵腐熟的有機肥料中養分多為有機態或緩效態，不能被作物直接吸收應用，只有分解轉化成速效態才能被作物吸收應用。所以，未發酵直接施用會使肥效減慢。
5、病蟲害的威脅。糞便中含有大腸菌、線蟲等病菌和益蟲，直接使用會招致病蟲害的傳達、作物發病，對食用農產品的人的身體安康也會發生影響;未腐熟有機物質在土壤中發酵時，容易滋生病菌與蟲害，招致植物病蟲害的發作。
6、引起燒根燒苗。不發酵的畜禽糞便施到農田，因為發酵不徹底，會發作“二次發酵”的現象，當發酵條件具有時，在微生物的活動下，生糞發酵;當發酵部位距根較近或作物植株較小時，發酵發生的熱量會影響作物生長，引起“燒根、燒苗”，嚴重時會招致植株死亡。
